ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในระบบ Fmoc เนื่องจากกลุ่มป้องกัน tBu ที่หมู่ไฮดรอกซิลของหมู่ไซด์เชนมีความเข้ากันได้ดีกับสภาวะที่ใช้ในการกำจัด Fmoc และสามารถกำจัดออกได้ง่ายด้วยกรด เช่น TFA ในขั้นตอนสุดท้ายของการสังเคราะห์ ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะที่ต้องการควบคุมสเตอริโอเคมีอย่างแม่นยำ โครงสร้าง D-allo-Thr ช่วยเพิ่มความเสถียรและลดการเกิดปฏิกิริยาข้างเคียงระหว่างการสังเคราะห์