1,1-ไดเมทอกซี่บิวเทน ใช้หลักly เป็นตัวทำละลายและสารกลางในปฏิกิริยาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการที่ไวต่อความชื้นและต้องการสภาวะไม่มีน้ำ ใช้สำหรับการป้องกันหมู่คาร์บอนิลในรูปแบบอะซีทัล และสามารถคืนสภาพเป็นอัลดีไฮด์ได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ๆ ทำหน้าที่เป็นแหล่งหมู่เมทอกซีในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ต่าง ๆ รวมถึงการผลิตน้ำหอมและสารปรุงแต่งรสชาติ คุณสมบัติความผันผวนปานกลางและขั้วทำให้เหมาะสำหรับใช้ในสารเคลือบพิเศษและเป็นสื่อปฏิกิริยาในการผลิตยา