ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบฟลูออรีนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเพิ่มขึ้น หมู่ฟังก์ชันอัลไคน์และกรดคาร์บอกซิลิกช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาคัปปลิง เช่น Sonogashira หรือ click chemistry ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้ ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมเนื่องจากผลดึงอิเล็กตรอนและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ให้โดยกลุ่ม difluorophenyl นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ตัวยับยั้ง kinase และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โดยการแทนที่ฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความจำเพาะต่อเป้าหมายและคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์