ไฮยาลูโรนิเดสถูกใช้อย่างแพร่หลายในขั้นตอนทางการแพทย์และความงามเนื่องจากความสามารถในการสลายกรดไฮยาลูรอนิก ในทางการแพทย์ มักใช้เพื่อเพิ่มการดูดซึมและการกระจายของยาที่ฉีด เช่น ยาชาเฉพาะที่หรือของเหลว โดยลดความต้านทานของเนื้อเยื่อ ทำให้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการผ่าตัดตา ซึ่งช่วยในการให้ยาชาและการจัดการภาวะเลือดออกในน้ำวุ้น นอกจากนี้ ยังใช้ในการให้ของเหลวใต้ผิวหนัง (hypodermoclysis) สำหรับผู้ป่วยที่ยากต่อการให้ทางหลอดเลือดดำ

ในการรักษาด้านความงาม ไฮยาลูโรนิเดสใช้เป็นยาแก้พิษเพื่อสลายฟิลเลอร์ที่基于กรดไฮยาลูรอนิกในกรณีที่แก้ไขเกินไป ความไม่สมมาตร หรือภาวะแทรกซ้อน เช่น การอุดตันของหลอดเลือด การประยุกต์ใช้นี้ช่วยให้แก้ไขได้รวดเร็วและลดผลข้างเคียง นอกจากนี้ ยังใช้ในการรักษาภาวะมีบุตรยากเพื่อปรับปรุงการทะลุผ่านของอสุจิระหว่างการฉีดอสุจิเข้าสู่ไซโทพลาซึม (ICSI) โดยรวมแล้ว ไฮยาลูโรนิเดสมีบทบาทที่หลากหลายในการเพิ่มประสิทธิภาพและความปลอดภัยของขั้นตอนบำบัดและความงามต่างๆ