ซูโครสฟอสโฟริเลสถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารสำหรับการผลิตไกลโคไซด์และอนุพันธ์น้ำตาลอื่นๆ มันเร่งปฏิกิริยาการเปลี่ยนซูโครสเป็นกลูโคส-1-ฟอสเฟตและฟรุกโตส ซึ่งเป็นสารกลางที่มีคุณค่าในกระบวนการเอนไซม์ต่างๆ เอนไซม์นี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์น้ำตาลหายากและโอลิโกซักคาไรด์ฟังก์ชันนัล ซึ่งมีแอปพลิเคชันเป็นสารให้ความหวานแคลอรีต่ำและพรีไบโอติก นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพและการปรับเปลี่ยนเนื้อสัมผัสของอาหาร ความสามารถในการถ่ายโอนกลุ่มไกลโคซิลทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในเทคโนโลยีชีวภาพสำหรับการสร้างผลิตภัณฑ์คาร์โบไฮเดรต新型