โปรติเอสย่อยสลายแบบเป็นกลางถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมต่างๆ เนื่องจากความสามารถในการย่อยสลายโปรตีนภายใต้สภาวะ pH เป็นกลาง ในอุตสาหกรรมอาหาร มันมีบทบาทสำคัญในการทำให้เนื้อสัตว์นุ่มขึ้น ปรับปรุงเนื้อสัมผัสและการย่อยสลาย นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตเบียร์เพื่อป้องกันการเกิดตะกอนโดยการย่อยสลายคอมเพล็กซ์โปรตีน-โพลีฟีนอล ซึ่งช่วยเพิ่มความชัดเจนของเบียร์และอายุการเก็บรักษา

ในการผลิตน้ำยาล้างจาน โปรติเอสย่อยสลายแบบเป็นกลางช่วยขจัดคราบจากโปรตีน เช่น เลือด ไข่ และหญ้าจากผ้า ทำให้เป็นส่วนผสมทั่วไปในน้ำยาซักผ้าและน้ำยาล้างจาน ความมีประสิทธิภาพที่อุณหภูมิปานกลางและ pH เป็นกลางทำให้เหมาะสำหรับผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดที่เป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อม

ในอุตสาหกรรมเครื่องหนัง มันช่วยในกระบวนการกำจัดขนและการบำบัดหนัง ทดแทนสารเคมีที่รุนแรงและลดผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ โปรติเอสย่อยสลายแบบเป็นกลางยังใช้ในชีววิทยาโมเลกุลและเทคโนโลยีชีวภาพสำหรับการแยกเซลล์และการแยกเนื้อเยื่อ สนับสนุนการวิจัยและการวินิจฉัย

มันยังใช้ในอาหารเสริมสุขภาพระบบย่อยอาหาร ซึ่งช่วยในการย่อยโปรตีนและอาจช่วยลดอาการไม่สบายท้องหลังมื้ออาหาร ในอุตสาหกรรมเครื่องสำอาง ช่วยสลายเซลล์ผิวที่ตายแล้วเพื่อให้ผิวเรียบเนียนขึ้น