Oxazine 4 Perchlorate ถูกใช้อย่างกว้างขวางในด้านการวิจัยทางวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี โดยเฉพาะในสาขาเคมีวิเคราะห์และชีววิทยาโมเลกุล สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นสารเรืองแสง (fluorescent dye) ในการติดตามและศึกษากระบวนการทางชีววิทยา เช่น การติดตามการเคลื่อนที่ของเซลล์ การศึกษากลไกการทำงานของโปรตีน และการวิเคราะห์ปฏิกิริยาทางเคมีในเซลล์ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนาเซ็นเซอร์ทางเคมีเพื่อตรวจวัดสารเคมีหรือสารชีวโมเลกุลที่มีความสำคัญทางการแพทย์และสิ่งแวดล้อม เนื่องจากมีคุณสมบัติการเรืองแสงที่ไวและแม่นยำ