2,6-ไดคลอโรไพริดีน เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีหลายชนิด โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและสารกำจัดศัตรูพืช ใช้เป็นวัตถุดิบในการผลิตสารกำจัดวัชพืชที่มีประสิทธิภาพสูง เช่น ไกลโฟเซต ซึ่งเป็นที่นิยมใช้กันอย่างแพร่หลายในภาคเกษตรกรรม นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการผลิตยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทและยาต้านจุลชีพในบางกรณี ด้วยคุณสมบัติทางเคมีที่เหมาะสม ทำให้มันเป็นสารกลางที่สำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ที่ซับซ้อน