ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากหมู่ไตรฟลูออร์เมทอกซีช่วยเพิ่มความคงตัวและประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างสารที่มีโครงสร้างเบนซามายด์ ซึ่งพบในผลิตภัณฑ์ยาหลายชนิด รวมถึงใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อพัฒนาโมเลกุลใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ