ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบฮีเทอโรไซคลิก เช่น พิรโรล ไพรีดีน และโครงสร้างพื้นฐานที่ขึ้นอยู่กับฟิวแรน ซึ่งพบได้บ่อยในโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ เนื่องจากความตอบสนองทางเคมีและความสามารถในการสร้างระบบวงแหวนที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างสีย้อมเรืองแสงและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ โดยแกนฟิวแรนช่วยเพิ่มคุณสมบัติอิเล็กตรอนอุดมสมบูรณ์ที่เป็นประโยชน์ในการประยุกต์ใช้ทางโอโตอิเล็กทรอนิกส์