ใช้เป็นตัวทำให้เกิดปฏิกิริยาในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างอนุพันธ์ของแอมิโนกรดและเปปไทด์ เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับหมู่อะมิโนได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เหมาะสมสำหรับการป้องกันหมู่ฟังก์ชันในขั้นตอนการสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน นอกจากนี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเพื่อสร้างสารตั้งต้นที่มีโครงสร้างเฉพาะ โดยเฉพาะสารที่ต้องการความเลือกจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ ความสามารถของหมู่ฟลูออรีนในการปรับปรุงคุณสมบัติด้านการดูดซึมและการจำแนกสารในระบบชีวภาพ ทำให้สารนี้มีความสำคัญในออกแบบโมเลกุลที่มีประสิทธิภาพสูง