ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีโครงสร้างเป็นพิเพอราซีน โดยทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นหรือสารตั้งต้นที่มีหมู่ป้องกัน (Boc) ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งในโมเลกุล หมู่ Boc จะป้องกันไนโตรเจนในพิเพอราซีนไม่ให้ทำปฏิกิริยาในขั้นตอนแรก ทำให้สามารถดัดแปลงหรือเติมหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ ที่ตำแหน่งต่าง ๆ ได้ โดยเฉพาะที่หมู่ไฮดรอกซีเมทิล ซึ่งสามารถนำไปทำปฏิกิริยาต่อ เช่น การแทนที่ การออกซิเดชัน หรือการเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นได้ หลังจากดำเนินขั้นตอนการสังเคราะห์ครบถ้วนแล้ว หมู่ Boc สามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ได้พิเพอราซีนที่มีหมู่ -NH เสรี ซึ่งมีความสำคัญในการสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพ ยาแก้ซึมเศร้า หรือสารยับยั้งเอนไซม์ต่าง ๆ จึงนิยมใช้สารนี้ในห้องปฏิบัติการวิจัยและอุตสาหกรรมยาเป็นอย่างมาก