ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่เป็นสารตั้งต้นในการผลิตยา โดยเฉพาะยาที่มีโครงสร้างเป็นสารอินทรีย์ที่มีธาตุฟลูออรีนและโบรมีน ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์หรือตัวรับในร่างกาย นิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนายาในกลุ่มยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาแก้โรคมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางในการสร้างสารฟลูออรีน-โบรมีนที่มีความเฉพาะเจาะจงสูงในห้องปฏิบัติการ