ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เนื่องจากสารอนุพันธ์ของ 1,2,4-ไตรอะซีน มักแสดงฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ฤทธิ์ต้านจุลชีพ ต้านไวรัส หรือต้านการอักเสบ จึงมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารตั้งต้นของยาใหม่ โดยเฉพาะสารที่มีหมู่ฟีนิลและหมู่เมธิลธิโอ ซึ่งอาจช่วยเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของเยื่อหุ้มเซลล์และเพิ่มความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบ heterocyclic อื่น ๆ ที่มีโครงสร้างซับซ้อนมากขึ้นในห้องปฏิบัติการ