3-Phosphonopropionic acid ใช้เป็นสารยับยั้งการก่อตัวของเกลือแร่ในระบบน้ำหล่อเย็นและน้ำในอุตสาหกรรม ช่วยป้องกันการเกิดตะกรันและสนิมในท่อและอุปกรณ์ นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตสารเคมีเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพของสารยับยั้งการกัดกร่อน ในอุตสาหกรรมเกษตร ใช้เป็นส่วนผสมในปุ๋ยเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการดูดซึมธาตุอาหารของพืช และยังสามารถใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับฟอสฟอรัส