อิลาพราซอลใช้ในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับกรดในกระเพาะอาหาร เช่น โรคกระเพาะอาหารอักเสบ โรคกรดไหลย้อน และแผลในกระเพาะอาหาร โดยยาชนิดนี้ช่วยลดการผลิตกรดในกระเพาะ ทำให้อาการต่าง ๆ บรรเทาลง นอกจากนี้ยังใช้ในการรักษาโรคติดเชื้อเฮลิโคแบคเตอร์ ไพโลไร ซึ่งเป็นสาเหตุหนึ่งของแผลในกระเพาะอาหาร อิลาพราซอลมักใช้ร่วมกับยาปฏิชีวนะเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการรักษา