ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีซึ่งเป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและเคมีอินทรีย์ สารนี้มีบทบาทเป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน (amine protecting group) ซึ่งช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งในโมเลกุล ทำให้สามารถสร้างพันธะใหม่ได้อย่างแม่นยำโดยไม่รบกวนหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างเปปไทด์หรือสารประกอบที่มีไนโตรเจนเป็นส่วนประกอบสำคัญ ความเสถียรของหมู่ tert-butyloxycarbonyl (Boc) ในสภาวะปฏิกิริยาหลายรูปแบบทำให้สารนี้มีประโยชน์สูงในห้องปฏิบัติการวิจัยและพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ