ใช้ในอุตสาหกรรมยาเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ของไพริมิดีนที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารเรืองแสงหรือสารที่ใช้ในวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ยังมีการประยุกต์ใช้ในกระบวนการพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความจำเพาะสูงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ