ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคอปเปอร์หรือแพลเลเดียมที่ต้องการหมู่โบโรเนตเป็นตัวทำปฏิกิริยา นิยมใช้ในการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการพัฒนายา เนื่องจากโครงสร้างอะซิทิดีนที่มีหมู่ป้องกัน tert-butyloxycarbonyl (Boc) ช่วยให้ควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้ดี และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายในขั้นตอนต่อไป หมู่เมทอกซีเบนซิลทำให้โมเลกุลมีความเข้ากันได้ดีกับตัวทำละลายอินทรีย์ และช่วยปรับคุณสมบัติการละลายในขั้นตอนสังเคราะห์หลายขั้นตอน