ใช้ในงานสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นโครงสร้างหลักหรือสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาปรับสมดุลทางจิตใจ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาต้านจุลชีพและยาต้านไวรัส เนื่องจากโครงสร้างไซโคลมีความเสถียรและสามารถปรับแต่งได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ