ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารยับยั้งคินาสและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพอื่นๆ ความสามารถในการจับไฮโดรเจนที่แข็งแกร่งทำให้มีคุณค่าในเคมีซูเปอร์โมเลกุลและระบบการรับรู้ไอออน ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ เนื่องจากความเสถียรและลักษณะการดึงอิเล็กตรอนของหมู่ไตรฟลูโรมีธิล แสดงประโยชน์ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ฟังก์ชันนัลที่มีความต้านทานความร้อนและเคมีที่เพิ่มขึ้น นอกจากนี้ ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยา เช่น สารต้านจุลชีพ หรือสารต้านการอักเสบ มีการนำไปใช้ในกระบวนการพัฒนาสารยับยั้งเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับโรคบางชนิด เช่น โรคเบาหวานหรือโรคมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างมีหมู่ไตรฟลูโรมีธิลที่ช่วยเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ ทำให้มีศักยภาพสูงในการนำไปพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม และยังใช้เป็นลิแกนด์ในเคมีประสานเพื่อสร้างสารประกอบโลหะทรานซิชันที่มีคุณสมบัติพิเศษสำหรับงานเร่งปฏิกิริยาหรือการตรวจวัดสารเคมี