Polyhexamethyleneguanidine hydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารฆ่าเชื้อและยาฆ่าเชื้อเนื่องจากคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ที่แข็งแกร่ง มีประสิทธิภาพต่อจุลินทรีย์หลากหลายประเภท รวมถึงแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อรา ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในสถานพยาบาล การบำบัดน้ำ ผลิตภัณฑ์สุขอนามัย อุตสาหกรรมสิ่งทอ การเกษตร และอุตสาหกรรมอาหาร ในด้านการดูแลสุขภาพ ใช้สำหรับการฆ่าเชื้อพื้นผิว การฆ่าเชื้ออุปกรณ์ทางการแพทย์ และเป็นส่วนประกอบในน้ำยารักษาแผล ยังใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเพื่อทำความสะอาดอุปกรณ์และพื้นผิวเพื่อป้องกันการปนเปื้อน นอกจากนี้ ยังรวมเข้าไปในผลิตภัณฑ์ดูแลส่วนบุคคล เช่น เจลล้างมือและเช็ดเปียก สำหรับคุณสมบัติฆ่าเชื้อ ในด้านการบำบัดน้ำ ช่วยควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ในสระว่ายน้ำ หอระบายความร้อน และระบบน้ำอุตสาหกรรม ในอุตสาหกรรมสิ่งทอ ช่วยป้องกันการสะสมของแบคทีเรียและเชื้อราในเนื้อผ้า ในด้านการเกษตร ใช้เป็นสารป้องกันและกำจัดเชื้อโรคในพืช ช่วยลดการแพร่กระจายของโรคพืช ความเสถียรและประสิทธิภาพที่ความเข้มข้นต่ำทำให้เป็นตัวเลือกที่ต้องการสำหรับการใช้งานฆ่าเชื้อต่างๆ