4-Isopropylpyrimidine-5-boronic acid ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่針對โรคระบบประสาทส่วนกลาง สารนี้มีบทบาทสำคัญในปฏิกิริยาครอส-คัปปลิงแบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งช่วยให้เกิดพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงที่มีประสิทธิภาพและเลือกสรรได้มากขึ้น นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการออกแบบโพลิเมอร์ขั้นสูงและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ กลุ่มโบรอนิกแอซิดของมันทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาเซ็นเซอร์สำหรับตรวจจับชีวโมเลกุลเฉพาะเจาะจง