1,5-ไดคลอโรไอโซควิโนลีนใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่างๆ โดยเฉพาะยาที่กำหนดเป้าหมายภาวะทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด โครงสร้างของมันมีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งมีความสำคัญในด้านเกษตรเคมีและวิทยาศาสตร์วัสดุ ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับนิวคลีโอไฟล์ทำให้เป็นหน่วยย่อยที่หลากหลายสำหรับการสร้างโครงสร้างเคมีที่แตกต่างกัน