(3-(เบนซิลอกซี)เบนซิล)ไฮดราซีน ไฮโดรคลอไรด์ เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการสังเคราะห์อนุพันธ์ไฮดราไซด์ ซึ่งมีคุณค่าในเคมีการแพทย์ กลุ่มฟังก์ชันเบนซิลอกซีและไฮดราซีนทำให้เป็นสารทำปฏิกิริยาที่หลากหลายสำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทอร์โรไซคลิก เช่น อินโดลและไพราซอล ซึ่งเป็นโครงสร้างทั่วไปในการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังสามารถใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยาหรือในการศึกษาพาธเวย์ชีวเคมีที่เกี่ยวข้องกับตัวยับยั้งไฮดราซีน การประยุกต์ใช้ยังพบในงานวิจัยที่มุ่งเน้นการออกแบบสารประกอบที่มีศักยภาพต้านมะเร็ง ต้านจุลินทรีย์ หรือต้านการอักเสบ