3-Ethynylbenzenesulfonamide ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มอัลไคน์และซัลโฟนาไมด์ ทำให้มีศักยภาพในการออกแบบโมเลกุลที่สามารถจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้อย่างจำเพาะ มักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ต้านเชื้อแบคทีเรีย ต้านมะเร็ง หรือออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำไปใช้ในกระบวนการทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของเอนไซม์หรือโปรตีนในร่างกาย