ใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลเพื่อตัดดีเอ็นเอที่ตำแหน่งเฉพาะ โดยเฉพาะในกระบวนการโคลนนิ่งแบบ directional cloning เนื่องจากสามารถตัดดีเอ็นเอที่ไซต์จำเพาะที่มีลำดับยาว 8 นิวคลีโอไทด์ ทำให้ลดโอกาสการตัดที่ผิดตำแหน่ง เหมาะสำหรับการสร้างไลบรารีดีเอ็นเอและการจัดเรียงยีน นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคการถอดรหัสจีโนมและการวิเคราะห์ดีเอ็นเอขนาดใหญ่ เช่น การทำ optical mapping หรือการเตรียมตัวอย่างสำหรับการถัดลำดับดีเอ็นเอแบบยาว (long-read sequencing)