เอนโดนิวคลีเอส AgeI ใช้กันอย่างแพร่หลายในชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการจัดการดีเอ็นเออย่างแม่นยำ เอนไซม์นี้จดจำลำดับเฉพาะ 5'-A^CCGGT-3' และตัดภายในตำแหน่งนี้ สร้างปลายติด (sticky ends) ที่ช่วยในการโคลนแบบมีทิศทาง เอนไซม์นี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างโมเลกุลดีเอ็นเอรีคอมบิแนนท์ โดยช่วยให้การเชื่อมต่อกับเวกเตอร์ที่เข้ากันได้มีประสิทธิภาพ AgeI ใช้บ่อยในงานโคลนยีน การทำแผนที่การจำกัด (restriction mapping) และการวิศวกรรมจีโนม ซึ่งต้องการความจำเพาะสูงและการย่อยที่สะอาด ความสามารถในการตัดที่ตำแหน่งหายากและเฉพาะเจาะจงทำให้เหมาะสำหรับการ subcloning ชิ้นส่วนดีเอ็นเอขนาดใหญ่และใช้ในโครงสร้างทางพันธุกรรมที่ซับซ้อน นอกจากนี้ AgeI ยังใช้ในงานตรวจวินิจฉัยและกระบวนการสังเคราะห์ชีวภาพที่ต้องการการแตกหักดีเอ็นเออย่างแม่นยำ