ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยา พบว่าสารอนุพันธ์ของพิระซิโดทริเอซีนมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นยาต้านจุลชีพ ยาต้านไวรัส และยาต้านการอักเสบ โครงสร้างที่มีหมู่เมธิลธิโอและเอทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของเยื่อหุ้มเซลล์ และเสริมฤทธิ์ในการยับยั้งเอนไซม์เป้าหมายบางชนิด จึงนิยมนำไปใช้ในขั้นตอนการคัดกรองสารออกฤทธิ์ใหม่ในห้องปฏิบัติการ