ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตยาแก้ปวดและอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ โครงสร้างของมันช่วยสนับสนุนการสร้างระบบเฮเทโรไซคลิกที่พบบ่อยในเคมียารักษาโรค ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันอะมิโนและเอสเตอร์ที่ทำปฏิกิริยาได้ ซึ่งช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและสีย้อมที่ต้องการอนุพันธ์ไอซอกซาโซล