ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคอปเปอร์-คาทาไลซ์ หรือปฏิกิริยาซูซูกิ สำหรับสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งมีความสำคัญในการพัฒนายาและสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน มักถูกนำมาใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านการอักเสบ หรือสารยับยั้งเอนไซม์ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยวัสดุใหม่ที่ต้องการโครงสร้างเฉพาะตัวจากสารอินดาโซล