สารละลายโซเดียมเททราเฟนิลบอเรต ใช้เป็นตัวตรวจจับไอออนของโลหะบางชนิด โดยเฉพาะอย่างยิ่งใช้ในการวิเคราะห์ปริมาณโพแทสเซียมในตัวอย่างทางชีวภาพและในดิน ซึ่งทำได้โดยการเกิดตะกอนสีขาวของโพแทสเซียมเททราเฟนิลบอเรตที่ไม่ละลายน้ำ ทำให้สามารถแยกหรือวัดปริมาณได้ นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อตกตะกอนและแยกแคทไอออนขนาดใหญ่ เช่น ไอออนของแอมโมเนียมที่มีน้ำหนักโมเลกุลสูง และไอออนของอัลคาลอยด์บางชนิด ซึ่งช่วยในการสกัดหรือทำให้บริสุทธิ์ได้