สเปอร์มิดีน ฟอสเฟต เฮกซาไฮเดรต มีการใช้งานในด้านชีววิทยาโมเลกุลและงานวิจัยเกี่ยวกับการชะลอวัย เนื่องจากมีบทบาทในการส่งเสริมกระบวนการออโตฟาจี (autophagy) ซึ่งเป็นกลไกที่เซลล์ใช้ทำความสะอาดและรีไซเคิลส่วนประกอบที่เสื่อมสภาพ ช่วยรักษาสุขภาพของเซลล์และยืดอายุการใช้งานของเซลล์ ในงานวิจัยด้านสุขภาพ มีการศึกษาเกี่ยวกับการใช้สารนี้เพื่อสนับสนุนการทำงานของระบบประสาท ป้องกันโรคเสื่อมของระบบประสาท เช่น โรคอัลไซเมอร์ และโรคพาร์กินสัน นอกจากนี้ยังมีการนำมาใช้ในผลิตภัณฑ์เสริมอาหารที่อ้างว่าช่วยเพิ่มพลังงาน ปรับสมดุลเมตาบอลิซึม และส่งเสริมสุขภาพหัวใจ ในห้องปฏิบัติการ สเปอร์มิดีน ฟอสเฟต เฮกซาไฮเดรตถูกใช้เป็นสารเติมแต่งในสื่อเพาะเลี้ยงเซลล์ โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับการเจริญเติบโตของเซลล์ การแบ่งเซลล์ และการควบคุมยีน เนื่องจากมันมีบทบาทในการเสถียรภาพของดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอ