ใช้ฮัลโลฟูจินอนเป็นสารต้านปรสิตในสัตว์ โดยเฉพาะในการควบคุมโรคโคคริดิโอซิสในสัตว์ปีก เช่น ไก่ ซึ่งเกิดจากโปรโตซัวกลุ่ม Eimeria spp. มีประสิทธิภาพสูงในการลดการแพร่พันธุ์ของปรสิตในลำไส้ ช่วยเพิ่มการเจริญเติบโตและประสิทธิภาพการใช้อาหารในสัตว์เลี้ยง นอกจากนี้ยังมีการศึกษาถึงฤทธิ์ในการยับยั้งการสร้างคอลลาเจน ทำให้ถูกพิจารณาในการวิจัยโรคบางชนิดที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบเรื้อรังหรือพังผืด เช่น โรคพังผืดในอวัยวะต่าง ๆ แต่การใช้ในมนุษย์ยังอยู่ในขั้นวิจัยและไม่เป็นการใช้ทั่วไป